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b9d5fd3aa7
268
startCode.cpp
268
startCode.cpp
@ -28,13 +28,13 @@ using namespace DGtal;
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struct hueFct{
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struct hueFct{
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inline
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inline
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unsigned int operator() (unsigned int aVal) const
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unsigned int operator() (unsigned int aVal) const
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{
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{
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HueShadeColorMap<unsigned int> hueShade(0,255);
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HueShadeColorMap<unsigned int> hueShade(0,255);
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Color col = hueShade((unsigned int)aVal);
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Color col = hueShade((unsigned int)aVal);
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return (((unsigned int) col.red()) << 16)| (((unsigned int) col.green()) << 8)|((unsigned int) col.blue());
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return (((unsigned int) col.red()) << 16)| (((unsigned int) col.green()) << 8)|((unsigned int) col.blue());
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}
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}
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};
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};
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// Définition du type de viewer à utiliser.
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// Définition du type de viewer à utiliser.
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@ -57,30 +57,30 @@ void randomSeeds(Image &image, const unsigned int nb, const int value);
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int main( int argc, char** argv )
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int main( int argc, char** argv )
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{
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{
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QApplication application(argc,argv);
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QApplication application(argc,argv);
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ViewerType viewer;
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ViewerType viewer;
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// Appel aux méthodes des exercices.
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// Appel aux méthodes des exercices.
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if (argc > 2)
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if (argc > 2)
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{
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{
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std::stringstream ssAlgo;
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std::stringstream ssAlgo;
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ssAlgo << std::string(argv[1]);
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ssAlgo << std::string(argv[1]);
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std::stringstream ssFile;
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std::stringstream ssFile;
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ssFile << std::string(argv[2]);
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ssFile << std::string(argv[2]);
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if (ssAlgo.str() == "Sandbox")
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if (ssAlgo.str() == "Sandbox")
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imageSandbox(viewer, ssFile.str());
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imageSandbox(viewer, ssFile.str());
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else if (ssAlgo.str() == "DT")
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else if (ssAlgo.str() == "DT")
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transformeeEnDistance(viewer, ssFile.str());
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transformeeEnDistance(viewer, ssFile.str());
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}
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}
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else
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else
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{
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{
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std::cout << "Les paramètres n'a pas été fourni." << std::endl;
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std::cout << "Les paramètres n'a pas été fourni." << std::endl;
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std::cout << "startCode <paramètre = {Sandbox | DT}> <nom du fichier>" << std::endl;
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std::cout << "startCode <paramètre = {Sandbox | DT}> <nom du fichier>" << std::endl;
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return 0;
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return 0;
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}
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}
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return application.exec();
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return application.exec();
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}
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}
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@ -94,38 +94,38 @@ int main( int argc, char** argv )
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*/
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*/
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void imageSandbox(ViewerType& viewer, std::string filename)
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void imageSandbox(ViewerType& viewer, std::string filename)
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{
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{
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// Lance le visusalisateur.
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// Lance le visusalisateur.
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viewer.show();
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viewer.show();
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//Chargement d'une image dans une structure de données ImageContainerBySTLVector.
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//Chargement d'une image dans une structure de données ImageContainerBySTLVector.
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std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
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std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
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Image3D image = GenericReader<Image3D>::import(inputFilename);
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Image3D image = GenericReader<Image3D>::import(inputFilename);
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// Obtention du domaine (taille) de l'image chargée.
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// Obtention du domaine (taille) de l'image chargée.
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Z3i::Domain initialDomain = image.domain();
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Z3i::Domain initialDomain = image.domain();
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// Définition du gradient des couleurs.
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// Définition du gradient des couleurs.
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GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
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GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
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gradient.addColor(Color::Red);
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gradient.addColor(Color::Red);
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gradient.addColor(Color::Yellow);
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gradient.addColor(Color::Yellow);
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gradient.addColor(Color::Green);
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gradient.addColor(Color::Green);
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gradient.addColor(Color::Cyan);
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gradient.addColor(Color::Cyan);
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gradient.addColor(Color::Blue);
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gradient.addColor(Color::Blue);
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gradient.addColor(Color::Magenta);
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gradient.addColor(Color::Magenta);
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gradient.addColor(Color::Red);
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gradient.addColor(Color::Red);
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float min = 0.0;
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float min = 0.0;
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float max = 0.0;
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float max = 0.0;
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for(Z3i::Domain::ConstIterator it= image.domain().begin(),
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for(Z3i::Domain::ConstIterator it= image.domain().begin(),
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itend = image.domain().end(); it != itend; ++it)
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itend = image.domain().end(); it != itend; ++it)
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{
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{
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if (image(*it) > 0)
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if (image(*it) > 0)
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viewer << *it;
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viewer << *it;
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}
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}
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viewer << SetMode3D(image.className(), "BoundingBox");
|
viewer << SetMode3D(image.className(), "BoundingBox");
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viewer << ViewerType::updateDisplay;
|
viewer << ViewerType::updateDisplay;
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}
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}
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@ -139,86 +139,86 @@ void imageSandbox(ViewerType& viewer, std::string filename)
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*/
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*/
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void transformeeEnDistance(ViewerType& viewer, std::string filename)
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void transformeeEnDistance(ViewerType& viewer, std::string filename)
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{
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{
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// Affichage de la visualisation.
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// Affichage de la visualisation.
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viewer.show();
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viewer.show();
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// Nombre du fichier à charger.
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// Nombre du fichier à charger.
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std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
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std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
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// Création du type d'image.
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// Création du type d'image.
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//Default image selector = STLVector
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//Default image selector = STLVector
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typedef ImageSelector<Z3i::Domain, unsigned char>::Type Image;
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typedef ImageSelector<Z3i::Domain, unsigned char>::Type Image;
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//Chargement du fichier image dans la structure.
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//Chargement du fichier image dans la structure.
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Image image = VolReader<Image>::importVol( inputFilename );
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Image image = VolReader<Image>::importVol( inputFilename );
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// Obtention du domaine (taille) de l'image.
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// Obtention du domaine (taille) de l'image.
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Z3i::Domain domain = image.domain();
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Z3i::Domain domain = image.domain();
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Image imageSeeds ( domain);
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Image imageSeeds ( domain);
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for ( Image::Iterator it = imageSeeds.begin(), itend = imageSeeds.end();it != itend; ++it)
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for ( Image::Iterator it = imageSeeds.begin(), itend = imageSeeds.end();it != itend; ++it)
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(*it)=1;
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(*it)=1;
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//imageSeeds.setValue(p0, 0 );
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//imageSeeds.setValue(p0, 0 );
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randomSeeds(imageSeeds, 70, 0);
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randomSeeds(imageSeeds, 70, 0);
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typedef functors::SimpleThresholdForegroundPredicate<Image> Predicate;
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typedef functors::SimpleThresholdForegroundPredicate<Image> Predicate;
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Predicate aPredicate(imageSeeds,0);
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Predicate aPredicate(imageSeeds,0);
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// Création de type et de l'objet pour appliquer la transformée.
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// Création de type et de l'objet pour appliquer la transformée.
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typedef DistanceTransformation<Z3i::Space,Predicate, Z3i::L2Metric> DTL2;
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typedef DistanceTransformation<Z3i::Space,Predicate, Z3i::L2Metric> DTL2;
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DTL2 dtL2(&domain, &aPredicate, &Z3i::l2Metric);
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DTL2 dtL2(&domain, &aPredicate, &Z3i::l2Metric);
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// Detection des distances minimales et maximales.
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// Detection des distances minimales et maximales.
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unsigned int min = 0;
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unsigned int min = 0;
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unsigned int max = 0;
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unsigned int max = 0;
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for(DTL2::ConstRange::ConstIterator it = dtL2.constRange().begin(),
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for(DTL2::ConstRange::ConstIterator it = dtL2.constRange().begin(),
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itend=dtL2.constRange().end();
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itend=dtL2.constRange().end();
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it!=itend;
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it!=itend;
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++it)
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++it)
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{
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{
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if( (*it) < min )
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if( (*it) < min )
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min=(*it);
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min=(*it);
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if( (*it) > max )
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if( (*it) > max )
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max=(*it);
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max=(*it);
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}
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}
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//Spécification des gradients de couleur pour la visualisation.
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//Spécification des gradients de couleur pour la visualisation.
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GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
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GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
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gradient.addColor(Color::Red);
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gradient.addColor(Color::Red);
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gradient.addColor(Color::Yellow);
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gradient.addColor(Color::Yellow);
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gradient.addColor(Color::Green);
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gradient.addColor(Color::Green);
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gradient.addColor(Color::Cyan);
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gradient.addColor(Color::Cyan);
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gradient.addColor(Color::Blue);
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gradient.addColor(Color::Blue);
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gradient.addColor(Color::Magenta);
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gradient.addColor(Color::Magenta);
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gradient.addColor(Color::Red);
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gradient.addColor(Color::Red);
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// Affectation du mode de visualisation 3D.
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// Affectation du mode de visualisation 3D.
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viewer << SetMode3D( (*(domain.begin())).className(), "Paving" );
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viewer << SetMode3D( (*(domain.begin())).className(), "Paving" );
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// Parcours de tous les voxels de l'image avec un iterateur sur le domaine.
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// Parcours de tous les voxels de l'image avec un iterateur sur le domaine.
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for(Z3i::Domain::ConstIterator it = domain.begin(), itend=domain.end();
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for(Z3i::Domain::ConstIterator it = domain.begin(), itend=domain.end();
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it!=itend;
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it!=itend;
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++it)
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++it)
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{
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{
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// Calcul de la transformée en distance pour le voxel courant.
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// Calcul de la transformée en distance pour le voxel courant.
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double valDist= dtL2( (*it) );
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double valDist= dtL2( (*it) );
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// Calcul du gradient de couleur pour cette distance.
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// Calcul du gradient de couleur pour cette distance.
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Color c= gradient(valDist);
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Color c= gradient(valDist);
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viewer << CustomColors3D(Color((float)(c.red()),
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viewer << CustomColors3D(Color((float)(c.red()),
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(float)(c.green()),
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(float)(c.green()),
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(float)(c.blue(),205)),
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(float)(c.blue(),205)),
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Color((float)(c.red()),
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Color((float)(c.red()),
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(float)(c.green()),
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(float)(c.green()),
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(float)(c.blue()),205));
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(float)(c.blue()),205));
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// Le viewer reçoit le prochain voxel pour visualisation.
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// Le viewer reçoit le prochain voxel pour visualisation.
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if (image(*it) > 0)
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if (image(*it) > 0)
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viewer << *it ;
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viewer << *it ;
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}
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}
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//viewer << ClippingPlane(0,1,0, -40) << Viewer3D<>::updateDisplay;
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//viewer << ClippingPlane(0,1,0, -40) << Viewer3D<>::updateDisplay;
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// Mise à jour du visualisateur après le parcours de tous le voxels.
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// Mise à jour du visualisateur après le parcours de tous le voxels.
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viewer<< Viewer3D<>::updateDisplay;
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viewer<< Viewer3D<>::updateDisplay;
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}
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}
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@ -231,21 +231,21 @@ void transformeeEnDistance(ViewerType& viewer, std::string filename)
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*
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*
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*/
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*/
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template<typename Image>
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template<typename Image>
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void randomSeeds(Image &image, const unsigned int nb, const int value)
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void randomSeeds(Image &image, const unsigned int nb, const int value)
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{
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{
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typename Image::Point p, low = image.domain().lowerBound();
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typename Image::Point p, low = image.domain().lowerBound();
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typename Image::Vector ext;
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typename Image::Vector ext;
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srand ( time(NULL) );
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srand ( time(NULL) );
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ext = image.extent();
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ext = image.extent();
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for (unsigned int k = 0 ; k < nb; k++)
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for (unsigned int k = 0 ; k < nb; k++)
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{
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{
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for (unsigned int dim = 0; dim < Image::dimension; dim++)
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for (unsigned int dim = 0; dim < Image::dimension; dim++)
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p[dim] = rand() % (ext[dim]) + low[dim];
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p[dim] = rand() % (ext[dim]) + low[dim];
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image.setValue(p, value);
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image.setValue(p, value);
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}
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}
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}
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}
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// //
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// //
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