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ccolin 2022-01-09 17:04:57 +01:00
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commit b9d5fd3aa7

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@ -28,13 +28,13 @@ using namespace DGtal;
struct hueFct{
inline
unsigned int operator() (unsigned int aVal) const
{
HueShadeColorMap<unsigned int> hueShade(0,255);
Color col = hueShade((unsigned int)aVal);
return (((unsigned int) col.red()) << 16)| (((unsigned int) col.green()) << 8)|((unsigned int) col.blue());
}
inline
unsigned int operator() (unsigned int aVal) const
{
HueShadeColorMap<unsigned int> hueShade(0,255);
Color col = hueShade((unsigned int)aVal);
return (((unsigned int) col.red()) << 16)| (((unsigned int) col.green()) << 8)|((unsigned int) col.blue());
}
};
// Définition du type de viewer à utiliser.
@ -57,30 +57,30 @@ void randomSeeds(Image &image, const unsigned int nb, const int value);
int main( int argc, char** argv )
{
QApplication application(argc,argv);
ViewerType viewer;
QApplication application(argc,argv);
ViewerType viewer;
// Appel aux méthodes des exercices.
if (argc > 2)
{
std::stringstream ssAlgo;
ssAlgo << std::string(argv[1]);
// Appel aux méthodes des exercices.
if (argc > 2)
{
std::stringstream ssAlgo;
ssAlgo << std::string(argv[1]);
std::stringstream ssFile;
ssFile << std::string(argv[2]);
if (ssAlgo.str() == "Sandbox")
imageSandbox(viewer, ssFile.str());
else if (ssAlgo.str() == "DT")
transformeeEnDistance(viewer, ssFile.str());
}
else
{
std::cout << "Les paramètres n'a pas été fourni." << std::endl;
std::cout << "startCode <paramètre = {Sandbox | DT}> <nom du fichier>" << std::endl;
return 0;
}
std::stringstream ssFile;
ssFile << std::string(argv[2]);
if (ssAlgo.str() == "Sandbox")
imageSandbox(viewer, ssFile.str());
else if (ssAlgo.str() == "DT")
transformeeEnDistance(viewer, ssFile.str());
}
else
{
std::cout << "Les paramètres n'a pas été fourni." << std::endl;
std::cout << "startCode <paramètre = {Sandbox | DT}> <nom du fichier>" << std::endl;
return 0;
}
return application.exec();
return application.exec();
}
@ -94,38 +94,38 @@ int main( int argc, char** argv )
*/
void imageSandbox(ViewerType& viewer, std::string filename)
{
// Lance le visusalisateur.
viewer.show();
// Lance le visusalisateur.
viewer.show();
//Chargement d'une image dans une structure de données ImageContainerBySTLVector.
std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
Image3D image = GenericReader<Image3D>::import(inputFilename);
//Chargement d'une image dans une structure de données ImageContainerBySTLVector.
std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
Image3D image = GenericReader<Image3D>::import(inputFilename);
// Obtention du domaine (taille) de l'image chargée.
Z3i::Domain initialDomain = image.domain();
// Obtention du domaine (taille) de l'image chargée.
Z3i::Domain initialDomain = image.domain();
// Définition du gradient des couleurs.
GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
gradient.addColor(Color::Red);
gradient.addColor(Color::Yellow);
gradient.addColor(Color::Green);
gradient.addColor(Color::Cyan);
gradient.addColor(Color::Blue);
gradient.addColor(Color::Magenta);
gradient.addColor(Color::Red);
// Définition du gradient des couleurs.
GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
gradient.addColor(Color::Red);
gradient.addColor(Color::Yellow);
gradient.addColor(Color::Green);
gradient.addColor(Color::Cyan);
gradient.addColor(Color::Blue);
gradient.addColor(Color::Magenta);
gradient.addColor(Color::Red);
float min = 0.0;
float max = 0.0;
float min = 0.0;
float max = 0.0;
for(Z3i::Domain::ConstIterator it= image.domain().begin(),
itend = image.domain().end(); it != itend; ++it)
{
if (image(*it) > 0)
viewer << *it;
}
for(Z3i::Domain::ConstIterator it= image.domain().begin(),
itend = image.domain().end(); it != itend; ++it)
{
if (image(*it) > 0)
viewer << *it;
}
viewer << SetMode3D(image.className(), "BoundingBox");
viewer << ViewerType::updateDisplay;
viewer << SetMode3D(image.className(), "BoundingBox");
viewer << ViewerType::updateDisplay;
}
@ -139,86 +139,86 @@ void imageSandbox(ViewerType& viewer, std::string filename)
*/
void transformeeEnDistance(ViewerType& viewer, std::string filename)
{
// Affichage de la visualisation.
viewer.show();
// Nombre du fichier à charger.
std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
// Affichage de la visualisation.
viewer.show();
// Nombre du fichier à charger.
std::string inputFilename = examplesPath + "/" + filename;
// Création du type d'image.
//Default image selector = STLVector
typedef ImageSelector<Z3i::Domain, unsigned char>::Type Image;
// Création du type d'image.
//Default image selector = STLVector
typedef ImageSelector<Z3i::Domain, unsigned char>::Type Image;
//Chargement du fichier image dans la structure.
Image image = VolReader<Image>::importVol( inputFilename );
// Obtention du domaine (taille) de l'image.
Z3i::Domain domain = image.domain();
//Chargement du fichier image dans la structure.
Image image = VolReader<Image>::importVol( inputFilename );
// Obtention du domaine (taille) de l'image.
Z3i::Domain domain = image.domain();
Image imageSeeds ( domain);
for ( Image::Iterator it = imageSeeds.begin(), itend = imageSeeds.end();it != itend; ++it)
(*it)=1;
//imageSeeds.setValue(p0, 0 );
randomSeeds(imageSeeds, 70, 0);
Image imageSeeds ( domain);
for ( Image::Iterator it = imageSeeds.begin(), itend = imageSeeds.end();it != itend; ++it)
(*it)=1;
//imageSeeds.setValue(p0, 0 );
randomSeeds(imageSeeds, 70, 0);
typedef functors::SimpleThresholdForegroundPredicate<Image> Predicate;
Predicate aPredicate(imageSeeds,0);
typedef functors::SimpleThresholdForegroundPredicate<Image> Predicate;
Predicate aPredicate(imageSeeds,0);
// Création de type et de l'objet pour appliquer la transformée.
typedef DistanceTransformation<Z3i::Space,Predicate, Z3i::L2Metric> DTL2;
DTL2 dtL2(&domain, &aPredicate, &Z3i::l2Metric);
// Création de type et de l'objet pour appliquer la transformée.
typedef DistanceTransformation<Z3i::Space,Predicate, Z3i::L2Metric> DTL2;
DTL2 dtL2(&domain, &aPredicate, &Z3i::l2Metric);
// Detection des distances minimales et maximales.
unsigned int min = 0;
unsigned int max = 0;
for(DTL2::ConstRange::ConstIterator it = dtL2.constRange().begin(),
itend=dtL2.constRange().end();
it!=itend;
++it)
{
if( (*it) < min )
min=(*it);
if( (*it) > max )
max=(*it);
}
// Detection des distances minimales et maximales.
unsigned int min = 0;
unsigned int max = 0;
for(DTL2::ConstRange::ConstIterator it = dtL2.constRange().begin(),
itend=dtL2.constRange().end();
it!=itend;
++it)
{
if( (*it) < min )
min=(*it);
if( (*it) > max )
max=(*it);
}
//Spécification des gradients de couleur pour la visualisation.
GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
gradient.addColor(Color::Red);
gradient.addColor(Color::Yellow);
gradient.addColor(Color::Green);
gradient.addColor(Color::Cyan);
gradient.addColor(Color::Blue);
gradient.addColor(Color::Magenta);
gradient.addColor(Color::Red);
//Spécification des gradients de couleur pour la visualisation.
GradientColorMap<long> gradient( 0,30);
gradient.addColor(Color::Red);
gradient.addColor(Color::Yellow);
gradient.addColor(Color::Green);
gradient.addColor(Color::Cyan);
gradient.addColor(Color::Blue);
gradient.addColor(Color::Magenta);
gradient.addColor(Color::Red);
// Affectation du mode de visualisation 3D.
viewer << SetMode3D( (*(domain.begin())).className(), "Paving" );
// Affectation du mode de visualisation 3D.
viewer << SetMode3D( (*(domain.begin())).className(), "Paving" );
// Parcours de tous les voxels de l'image avec un iterateur sur le domaine.
for(Z3i::Domain::ConstIterator it = domain.begin(), itend=domain.end();
it!=itend;
++it)
{
// Parcours de tous les voxels de l'image avec un iterateur sur le domaine.
for(Z3i::Domain::ConstIterator it = domain.begin(), itend=domain.end();
it!=itend;
++it)
{
// Calcul de la transformée en distance pour le voxel courant.
double valDist= dtL2( (*it) );
// Calcul de la transformée en distance pour le voxel courant.
double valDist= dtL2( (*it) );
// Calcul du gradient de couleur pour cette distance.
Color c= gradient(valDist);
viewer << CustomColors3D(Color((float)(c.red()),
(float)(c.green()),
(float)(c.blue(),205)),
Color((float)(c.red()),
(float)(c.green()),
(float)(c.blue()),205));
// Le viewer reçoit le prochain voxel pour visualisation.
if (image(*it) > 0)
viewer << *it ;
}
// Calcul du gradient de couleur pour cette distance.
Color c= gradient(valDist);
viewer << CustomColors3D(Color((float)(c.red()),
(float)(c.green()),
(float)(c.blue(),205)),
Color((float)(c.red()),
(float)(c.green()),
(float)(c.blue()),205));
// Le viewer reçoit le prochain voxel pour visualisation.
if (image(*it) > 0)
viewer << *it ;
}
//viewer << ClippingPlane(0,1,0, -40) << Viewer3D<>::updateDisplay;
// Mise à jour du visualisateur après le parcours de tous le voxels.
viewer<< Viewer3D<>::updateDisplay;
//viewer << ClippingPlane(0,1,0, -40) << Viewer3D<>::updateDisplay;
// Mise à jour du visualisateur après le parcours de tous le voxels.
viewer<< Viewer3D<>::updateDisplay;
}
@ -231,21 +231,21 @@ void transformeeEnDistance(ViewerType& viewer, std::string filename)
*
*/
template<typename Image>
void randomSeeds(Image &image, const unsigned int nb, const int value)
{
typename Image::Point p, low = image.domain().lowerBound();
typename Image::Vector ext;
srand ( time(NULL) );
void randomSeeds(Image &image, const unsigned int nb, const int value)
{
typename Image::Point p, low = image.domain().lowerBound();
typename Image::Vector ext;
srand ( time(NULL) );
ext = image.extent();
ext = image.extent();
for (unsigned int k = 0 ; k < nb; k++)
{
for (unsigned int dim = 0; dim < Image::dimension; dim++)
p[dim] = rand() % (ext[dim]) + low[dim];
for (unsigned int k = 0 ; k < nb; k++)
{
for (unsigned int dim = 0; dim < Image::dimension; dim++)
p[dim] = rand() % (ext[dim]) + low[dim];
image.setValue(p, value);
}
}
image.setValue(p, value);
}
}
// //
///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////